Modeling and analysis of biological data
Obsah
- Úvod
- Projekty s institucionální podporou
- Smluvní výzkum
- Spolupráce s průmyslem
- Členové výzkumného týmu
- Reference
Úvod
Výzkumy v biomedicínské oblasti jsou zaměřeny na pochopení biologických pochodů u živých organismů, především u organismu lidského. Jsou zkoumány vlivy různých onemocnění, možnosti zlepšování zdravotní péče, zdokonalování léčebných postupů, vyvíjeny bezpečné a efektivní způsoby prevence a léčení chorob a mnoho dalšího.
Biologické systémy jsou obecně velmi složité a jejich funkce ovlivňuje velké množství faktorů. Základem modelování těchto systémů je podrobná analýza a specifikace systému. Náš výzkumný tým v oblasti biomedicínckých výzkumů spolupracuje např. s Hematologicko-onkologickým oddělením Fakultní Nemocnice v Plzni na vývoji výpočetního nástroje, který by zpřesnil výpočet HLA (human leukocyte antigen) kompatibility dárce a příjemnce (který je rozhodující pro úspěch transplantace) a urychlil vyhledání vhodného dárce kostní dřeně.
V současnosti se zabýváme:
- vývojem pokročilých metod vyhledávání dárců využívající dynamicky se rozvíjející znalosti DNA
- analýzou genetické diverzity a alelických skupin v datech registru kostní dřeně (výskyt řídkých a neběžných alel a antigenů)
Provádíme analýzy a vyhodnocení dat např. pro medicíncké centrum, které se zabývá zvýšením kvality života a prevence civilizačních chorob způsobených zejména stresem prostřednictvím terapií s využitím působení metody Mesodiencefalické modulace na lidský organismus. Konkrétně zkoumáme vliv MDM léčby na zlepšení zdravotního stavu pacienta při léčbě poruchy erekce, při léčbě chronické bolesti a při léčbě hojení chronických ran.
Doposud byly vytvořeny následující softwary, zařízení a technologie:
- Aplikace pro HLA Laboratoř a TC (CELAB-CETRA)
- Program pro dárcovská centra
- Moduly pro integraci a rozšíření systému EMDIS
Projekty s institucionální podporou
- TA01010342 - Výzkum a vývoj pokročilých IT technologií podpory vyhledávání dárce pro transplantaci kostní dřeně
Smluvní výzkum
- MDM Centrum.s.r.o: Studie – Kvantifikace vlivu MDM léčby na zdravotní stav s využitím dat pacientů
Spolupráce:
V této oblasti výzkumu úzce spolupracujeme s následujícími organizacemi:
- Hematologicko-onkologické oddělení Fakultní Nemocnice v Plzni
- Nadace pro transplantace kostní dřeně
- Českým národní registr dárců dřeně
- Centrum informatizace a výpočetní techniky ZČU
- MDM Centrum.s.r.o
Členové výzkumného týmu:
- Doc. Ing. Eduard Janeček, CSc.
- Ing. Lucie Houdová
- Ing. Andrea Zápotocká, Ph.D.,
- Ing. Daniel Georgiev, Ph.D.,
- Ing. Miloš Fetter
Reference: