Studentské práce
Detail studentské práce
Title: | Analýza přístupů pro zpracování genomických dat |
---|---|
Typ práce: | Bakalářská práce , Projekt 5 , Projekt 4 |
Obor: | |
Rok zadání: | 2022/2023 |
Zadáno: | volné |
Dokončeno: | |
Investor: | Houdová Lucie |
Detail
Metody sekvenování se používají pro zjištění genetické informace, mimo jiné i u člověka. V dnešní době se zkoumá vliv konkrétních genů, jejich variant a možnosti jejich klinického uplatnění. V našich projektech se zabýváme konkrétně uplatněním v rámci hemato-onkologických onemocnění, konkrétně pro pochopení chování nádorového onemocnění a možnosti využití výsledků specifické léčby. Metody analýz získávaných dat jsou náročné a vyžadují kvalitní bioinformatické zázemí - od databázových sytémů po specifické analytické nástroje. V rámci projektů/BP se předpokládá:
Seznámení a prozkoumání metod a technologií DNA sekvenování
Seznámení s dostupnými databázemi uchovávající sekvenační data a jejich obsahem
Prostudování přístupů a nástrojů pro zpracování genomických dat a jejich vyhodnocení (výhody, nevýhody, výkonost, vhodnost použití)
Vytvoření nástroje na automatické vyhodnocování nástrojů/přístupů
Specifické zaměření (Sanger sequencing, next generation sequencing, and long-read sequencing) se bude odvíjet na základě dohody se studentem, který se dané téma vybere.
Pokud by Vás téma nadchlo, je možné na něj následně navázat dalšími projekty i diplomovou prací.